Das bedeutendste Bauwerk in Fatehpur Sikri ist Jami Masjid, die wohl bekannteste Moschee in ganz Indien.

Die Moschee wurde, wie eine Inschrift besagt, 1572 vollendet. Als Vorbild diente die Bibi Khanam Moschee in Samarkand. Der englische Reisende Finch beschrieb sie 1611 als die göttlichste Moschee des Ostens.

Das Äussere wirkt eher bescheiden, aber das Innere, ist auf das Prächtigste mit Blütenarabesken und geometrischen Mustern in verschiedenen Farben geschmückt.

Die Hauptgebetshalle ist mit geometrischen, in den Sandstein eingelegten Marmormustern und gemalten Arabesken und Blumenmotiven reich verziert.

Im Hof befindet sich auch ein Wasserbecken für die rituellen Waschungen. Hier waschen die Gläubige zuerst dreimal die Hände bis zu den Gelenken, dann spülen sie Mund und Nasenlöcher und waschen wiederum jeweils dreimal Gesicht und Arme bis zum Ellbogen und abschließend die Füße bis zum Knöchel.